分子对接的模型
分子对接的模型 一、分子对接的模型与分子识别 为了理解分子识别的过程,生物学家们发展了不同模型,尽管非常简单, […]
新发布的SPARKv10.3带来新的片段数据库和新的高级过滤功能可以用来控制结果的化学和物理化学性质的空间。在本案例中我们在一个二肽基二肽酶IV抑制剂( Dipeptidyl Peptidase IV, DPP-IV) 的搜索中应用这些新功能特性,您可以了解到如何用SPARK快速的生成新的DPP-IV抑制剂,并设计出各种性质良好的、具有自主知识产权的新化合物。
本文介绍了Forge进行3D-QSAR的基本原理与优势。总的来说,Forge集成了活性构象建模,分子叠合,3D-QSAR建模(PLS)一整套流程。这个流程基本可以自动执行,您不必再花几周、几个月时间去试各种叠合,现在几分钟就可以完成传统3D-QSAR枯燥的工作。
以AMBER12为接口进行QM/MM计算 本教程解释了如何用AMBER 12与Gaussian 09进行QM/MM模拟。在本教程中,包含了在QM与MM区切断一个共价键的演示。