FLARE
Flare V2是Flare的最新版本,一款开创性的基于结构的药物设计软件。Flare V2包含了:1)蛋白结构准备;2)蛋白静电相互作用势分析;3)静电互补性打分;4)WaterSwap结合自由能计算;4)3D-RISM水分子的位置值与稳定性计算;5)分子对接;6)Pyhton API任务自动化与自定义工作流。
OpenEye软件是一个药物发现与设计平台,为大规模的药物设计与分子模拟应用而开发。它不仅具有严格的科学意义、还兼顾计算速度、可拓展性以及平台可用性。OpenEye药物设计软件聚焦于先导物识别与优化, 尤其擅长于化学信息学、构象生成、分子对接、形状比较,静电计算与比较,x-衍射晶体学,分子可视化以及数据分析。OpenEye软件支持多CPU/多核心计算,支持Linux,Windows与Mac OS X。OpenEye软件授权灵活,主要目的是最大的释放您的计算能力,指定用户的site license让您可以在任意的机器、不限数量机器上计算您的作业。
LigandScout是Inte:Ligand公司的旗舰产品,一款集3D-药效团模型识别、虚拟筛选、精确虚拟筛选的集成平台。支持基于配体或基于结构的药效团建模;高性能叠合算法与构象搜索技术,其具有前所未有的筛选速度与高品质预测质量。提供了筛选分析工具、ROC曲线绘制、分子对接等功能。