Category Archives: Flare

Flare的Python扩展

Flare Python——任务自定义与自动化

FLARE提供Python接口,可以更高效地创建自己的工作流,常见任务自动化,用Python模块扩展Flare以及添加自定义控件。Flare Python API使您能够自定义Flare专用菜单或新功能。免费提供的扩展提供了额外的可选功能,使得Flare功能可无限拓展。无论是开发您自己的扩展程序还是使用我们的扩展程序,我们都会提供清晰的文档和示例并提供支持,以确保您拥有正确的信息来做出最佳决策。

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自由能循环

Flare FEP

本文介绍了Flare FEP的特性,包括:不影响准确度的情况下近乎1倍的速度提升;自动的中间体添加;改进的拓扑构造容纳更多的分子;提升的预测性能与准确度;易于使用、易于结果分析。总的来说Flare FEP兼具速度、精度与易用性,极具竞争力。

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Field QSAR

QSAR Models

本文总结了Forge的QSAR建模的方法:定量与定性的方法。其中定量的方法包括:Field QSAR,机器学习方法;定性方法包括:Activity Atlas与Activity Miner。Field QSAR、Activity Atlas与Activity Miner可以建立解释性模型,用于指导分子设计;而机器学习方法仅是预测模型、不能指导分子设计。此外,机器学习模型不仅可以用来建立回归预测模型,还可以采用分级数据建立分类预测模型。

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药效团识别流程

FieldTemplater

FieldTemplater药效团识别的假设是:两个分子以相似的结合模式(相互作用方式)结合到蛋白的同一个结合位点,因此化合物应该有高度相似的场点模式。FieldTemplater因此遍历一组配体的构象空间、并识别其公共场模式。多个结构多样化合物的场模式很可能就解释了这些化合物与靶标的结合模式。

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